Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

Profiling transcriptome complexity and secondary metabolite synthesis in a benthic soft coral, Sinularia polydactyla Hoover, C.A.; Slattery, M.; Marsh, A.G. (2007). Profiling transcriptome complexity and secondary metabolite synthesis in a benthic soft coral, Sinularia polydactyla. Mar. Biotechnol. 9(2): 166-178. https://dx.doi.org/10.1007/s10126-006-6048-y In: Marine Biotechnology. Springer-Verlag: New York. ISSN 1436-2228; e-ISSN 1436-2236

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Non-open access 353260 [ aanvragen ]

---

Trefwoorden

Animal products > Coral Chemical defense Interspecific relationships > Predation Sinularia polydactyla (Ehrenberg, 1834) [WoRMS] Marien/Kust

Author keywords

chemical defense; phenotypic plasticity; predation; Sinularia; softcoral transcriptome

---

Auteurs		Top
Hoover, C.A. Slattery, M. Marsh, A.G.

---

Abstract

Sinularia polydactyla, an abundant Indo-Pacific soft coral species, exhibits biochemical phenotypic plasticity, prompting investigations into differences in mRNA diversity and complexity in response to predation stress. Changes in transcriptome complexity of S. polydactyla cDNA libraries were measured using reannealing rate assays that employ an informatics-based analysis of kinetic profiles. This method allows for quick, high-throughput analysis of sequence complexity and has been used to compare transcriptome-level differences in other marine invertebrates. Here, S. polydactyla colonies were transplanted between two sites exhibiting high and low predation levels. Statistically significant differences between bite scar counts found on different transplant groups suggest site-specific variation in predation. Changes in mRNA pool complexity were quantified to indicate shifts in secondary metabolite concentration between treatment groups. Examining the complexity of the mRNA pool in this soft coral is one of the first steps toward understanding the mechanisms of phenotypic plasticity at a biochemical and molecular level.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs