Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Estimating the efficiency of fish cross-species cDNA microarray hybridization
Cohen, R.; Chalifa-Caspi, V.; Williams, T.D.; Auslander, M.; George, S.G.; Chipman, J.K.; Tom, M. (2007). Estimating the efficiency of fish cross-species cDNA microarray hybridization. Mar. Biotechnol. 9(4): 491-499. https://dx.doi.org/10.1007/s10126-007-9010-8
In: Marine Biotechnology. Springer-Verlag: New York. ISSN 1436-2228; e-ISSN 1436-2236
|  |
| Trefwoorden |
Cross breeding
Marien/Kust |
| Author keywords |
bony fish; cross-species; cDNA hybridization; microarray; transcriptomesequence comparisons |
| Auteurs | | Top |
- Cohen, R.
- Chalifa-Caspi, V.
- Williams, T.D.
- Auslander, M.
|
- George, S.G.
- Chipman, J.K.
- Tom, M.
|
|
| Abstract |
Using an available cross-species cDNA microarray is advantageous for examining multigene expression patterns in non-model organisms, saving the need for construction of species-specific arrays. The aim of the present study was to estimate relative efficiency of cross-species hybridizations across bony fishes, using bioinformatics tools. The methodology may serve also as a model for similar evaluations in other taxa. The theoretical evaluation was done by substituting comparative whole-transcriptome sequence similarity information into the thermodynamic hybridization equation. Complementary DNA sequence assemblages of nine fish species belonging to common families or suborders and distributed across the bony fish taxonomic branch were selected for transcriptome-wise comparisons. Actual cross-species hybridizations among fish of different taxonomic distances were used to validate and eventually to calibrate the theoretically computed relative efficiencies. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
