Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

Flow cytometric enumeration of marine viral populations at low abundances Mojica, K.D.A.; Evans, C.; Brussaard, C.P.D. (2015). Flow cytometric enumeration of marine viral populations at low abundances, in: Mojica, K.D.A. Viral lysis of marine microbes in relation to vertical stratification. pp. 159-171 In: Mojica, K.D.A. (2015). Viral lysis of marine microbes in relation to vertical stratification. PhD Thesis. Universiteit van Amsterdam: Amsterdam. ISBN 978-94-91407-20-8. 247 pp. hdl.handle.net/11245/1.487499 Is gerelateerd aan: Mojica, K.D.A.; Evans, C.; Brussaard, C.P.D. (2014). Flow cytometric enumeration of marine viral populations at low abundances. Aquat. Microb. Ecol. 71(3): 203–209. http://dx.doi.org/10.3354/ame01672, meer

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ [ aanvragen ]

---

Author keywords

Flow cytometry; Low abundance; Virus enumeration

---

Auteurs		Top
Mojica, K.D.A. Evans, C. Brussaard, C.P.D.

---

Abstract

Flow cytometric enumeration has advanced our ability to analyze aquatic virus samples and thereby our understanding of the ecological role viruses play in the oceans. However, low virus abundances are underestimated using the current flow cytometry (FCM) protocol. Our results revealed that low dilutions (<30-fold) not only decreased the total virus count but also limited the ability to differentiate between virus clusters. Here we report a simple and efficient method optimization for improving virus counts and optical resolution at low abundances. Raising the pH of the Tris-EDTA (TE) buffer to 8.2 successfully countered the effect of insufficient buffering capacity at low dilutions, which is caused by the higher proportion of acidic glutaraldehyde fixative in the final sample. The higher buffer pH did not interfere with virus counts at higher dilutions. We therefore recommend amendment of the standard FCM aquatic virus enumeration protocol using a TE buffer with pH 8.2 as a simple and efficient improvement.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs