Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Evaluation of reference genes for RT-qPCR studies in the seagrass Zostera muelleri exposed to light limitation
Schliep, M.; Pernice, M.; Sinutok, S.; Bryant, C.V.; York, P.H.; Rasheed, M.A.; Ralph, P.J. (2015). Evaluation of reference genes for RT-qPCR studies in the seagrass Zostera muelleri exposed to light limitation. NPG Scientific Reports 5(17051): 11 pp. http://dx.doi.org/10.1038/srep17051
In: Scientific Reports (Nature Publishing Group). Nature Publishing Group: London. ISSN 2045-2322; e-ISSN 2045-2322, meer
|   |
| Trefwoorden |
Zostera muelleri Irmisch ex Ascherson, 1867 [WoRMS]
Marien/Kust |
| Auteurs | | Top |
- Schliep, M.
- Pernice, M.
- Sinutok, S.
- Bryant, C.V.
|
- York, P.H.
- Rasheed, M.A.
- Ralph, P.J.
|
|
| Abstract |
Seagrass meadows are threatened by coastal development and global change. In the face of these pressures, molecular techniques such as reverse transcription quantitative real-time PCR (RT-qPCR) have great potential to improve management of these ecosystems by allowing early detection of chronic stress. In RT-qPCR, the expression levels of target genes are estimated on the basis of reference genes, in order to control for RNA variations. Although determination of suitable reference genes is critical for RT-qPCR studies, reports on the evaluation of reference genes are still absent for the major Australian species Zostera muelleri subsp. capricorni (Z. muelleri). Here, we used three different software (geNorm, NormFinder and Bestkeeper) to evaluate ten widely used reference genes according to their expression stability in Z. muelleri exposed to light limitation. We then combined results from different software and used a consensus rank of four best reference genes to validate regulation in Photosystem I reaction center subunit IV B and Heat Stress Transcription factor A-gene expression in Z. muelleri under light limitation. This study provides the first comprehensive list of reference genes in Z. muelleri and demonstrates RT-qPCR as an effective tool to identify early responses to light limitation in seagrass. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
