Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Guidelines for DNA taxonomy, with a focus on the meiofauna
In: Marine Biodiversity. Springer: Heidelberg; Berlin. ISSN 1867-1616; e-ISSN 1867-1624
|  |
| Trefwoorden |
Biodiversity
Identification
Marien/Kust |
| Author keywords |
ABGD; BP&P; COI; Cryptic species; GMYC; PTP |
| Auteurs | | Top |
- Fontaneto, D.
- Flot, J.-F.
- Tang, C.Q.
|
|
|
| Abstract |
Describing biological diversity is a challenging endeavour, especially for the small, cryptic animals that make up the meiofauna. The field of DNA taxonomy, i.e., the use of DNA to delineate species boundaries, is rapidly growing and changing; herein we review the recent advances in the acquisition of DNA sequence data and the analytical tools for DNA-based species delimitation, with a focus on applications to the meiofauna. After providing general guidelines on the data collection and analysis steps (sampling design, sequencing, phasing of nuclear markers, and sequence alignment), we explain the rationale and usage of several widely used or promising methods developed for delineating species from single-locus data sets (distance-based DNA barcoding, automated barcode gap discovery, K/?, generalized mixed Yule–coalescent models, Poisson tree process model, and haplowebs). As it is increasingly recognised that several loci are required to delineate species accurately, we then briefly outline multilocus species delimitation approaches (Structure, Structurama, Bayesian phylogenetics & phylogeography, SpedeSTEM, O’Meara’s heuristic search, and several newly published Bayesian approaches based on the multispecies coalescent). |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
