Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Determination of ligand pathways in globins. Apolar tunnels versus polar gates
Salter, M.; Blouin, G.; Soman, J.; Singleton, E.; Dewilde, S.; Moens, L.; Pesce, A.; Nardini, M.; Bolognesi, M.; Olson, J. (2012). Determination of ligand pathways in globins. Apolar tunnels versus polar gates. J. Biol. Chem. 287(40): 33163-33178. https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M112.392258
In: Journal of Biological Chemistry. American Society for Biochemistry and Molecular Biology: Baltimore, etc.. ISSN 0021-9258; e-ISSN 1083-351X
|   |
| Auteurs | | Top |
- Salter, M.
- Blouin, G.
- Soman, J.
- Singleton, E.
|
- Dewilde, S.
- Moens, L.
- Pesce, A.
|
- Nardini, M.
- Bolognesi, M.
- Olson, J.
|
| Abstract |
Although molecular dynamics simulations suggest multiple interior pathways for O2 entry into and exit from globins, most experiments indicate well defined single pathways. In 2001, we highlighted the effects of large-to-small amino acid replacements on rates for ligand entry and exit onto the three-dimensional structure of sperm whale myoglobin. The resultant map argued strongly for ligand movement through a short channel from the heme iron to solvent that is gated by the distal histidine (His-64(E7)) near the solvent edge of the porphyrin ring. In this work, we have applied the same mutagenesis mapping strategy to the neuronal mini-hemoglobin from Cerebratulus lacteus (CerHb), which has a large internal tunnel from the heme iron to the C-terminal ends of the E and H helices, a direction that is 180° opposite to the E7 channel. Detailed comparisons of the new CerHb map with expanded results for Mb show unambiguously that the dominant (>90%) ligand pathway in CerHb is through the internal tunnel, and the major (>75%) ligand pathway in Mb is through the E7 gate. These results demonstrate that: 1) mutagenesis mapping can identify internal pathways when they exist; 2) molecular dynamics simulations need to be refined to address discrepancies with experimental observations; and 3) alternative pathways have evolved in globins to meet specific physiological demands. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
