Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Toward molecular trait-based ecology through integration of biogeochemical, geographical and metagenomic data
Raes, J.; Letunic, I.; Yamada, T.; Jensen, L.; Bork, P. (2011). Toward molecular trait-based ecology through integration of biogeochemical, geographical and metagenomic data. Mol. Syst. Biol. 7(473): 9 pp. dx.doi.org/10.1038/msb.2011.6
In: Molecular Systems Biology. Nature Publishing Group/EMBO Press: London. e-ISSN 1744-4292
|   |
| Trefwoord |
|
| Author keywords |
ecosystems biology; environmental genomics; metagenomics; microbiology;molecular trait-based ecology |
| Auteurs | | Top |
- Raes, J.
- Letunic, I.
- Yamada, T.
|
|
|
| Abstract |
Using metagenomic 'parts lists' to infer global patterns on microbial ecology remains a significant challenge. To deduce important ecological indicators such as environmental adaptation, molecular trait dispersal, diversity variation and primary production from the gene pool of an ecosystem, we integrated 25 ocean metagenomes with geographical, meteorological and geophysicochemical data. We find that climatic factors (temperature, sunlight) are the major determinants of the biomolecular repertoire of each sample and the main limiting factor on functional trait dispersal (absence of biogeographic provincialism). Molecular functional richness and diversity show a distinct latitudinal gradient peaking at 20 degrees N and correlate with primary production. The latter can also be predicted from the molecular functional composition of an environmental sample. Together, our results show that the functional community composition derived from metagenomes is an important quantitative readout for molecular trait-based biogeography and ecology. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
