Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Genomic characterization of novel dolphin papillomaviruses provides indications for recombination within the Papillomaviridae
Rector, A.; Stevens, H.; Lacave, G.; Lemey, P.; Mostmans, S.; Salbany, A.; Vos, M.; Van Doorslaer, K.; Ghim, S.; Rehtanz, M.; Bossart, G.; Jenson, A.; Van Ranst, M. (2008). Genomic characterization of novel dolphin papillomaviruses provides indications for recombination within the Papillomaviridae. Virology 378(1): 151-161. dx.doi.org/10.1016/j.virol.2008.05.020
In: Virology. Elsevier: San Diego. ISSN 0042-6822; e-ISSN 1096-0341
|  |
| Trefwoorden |
Cetacea [WoRMS]; Papillomaviridae [WoRMS]; Tursiops truncatus (Montagu, 1821) [WoRMS]
Marien/Kust |
| Author keywords |
Papillomaviridae; Cetacea; bottlenose dolphin (Tursiops truncatus);condylomata; evolution; phylogeny; bootscanning; recombination;selection |
| Auteurs | | Top |
- Rector, A.
- Stevens, H.
- Lacave, G.
- Lemey, P.
- Mostmans, S.
|
- Salbany, A.
- Vos, M.
- Van Doorslaer, K.
- Ghim, S.
|
- Rehtanz, M.
- Bossart, G.
- Jenson, A.
- Van Ranst, M.
|
| Abstract |
Phylogenetic analysis of novel dolphin (Tursiops truncatus) papillomavirus sequences, TtPV1, -2, and -3, indicates that the early and late protein coding regions of their genomes differ in evolutionary history. Sliding window bootscan analysis showed a significant a change in phylogenetic clustering, in which the grouped sequences of TtPV1 and -3 move from a cluster with the Phocoena spinipinnis PsPV1 in the early region to a cluster with TtPV2 in the late region. This provides indications for a possible recombination event near the end of E2/beginning of L2. A second possible recombination site could be located near the end of L1, in the upstream regulatory region. Selection analysis by using maximum likelihood models of codon substitutions ruled out the possibility of intense selective pressure, acting asymmetrically on the viral genomes, as an alternative explanation for the observed difference in evolutionary history between the early and late genomic regions of these cetacean papillomaviruses. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
