Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Coping with cold: the genome of the versatile marine Antarctica bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125
Médigue, C.; Krin, E.; Pascal, G.; Barbe, V.; Bernsel, A.; Bertin, P.N.; Cheung, F.; Cruveiller, S.; D'Amico, S.; Duilio, A.; Fang, G.; Feller, G.; Ho, C.; Mangenot, S.; Marino, G.; Nilsson, J.; Parrilli, E.; Rocha, E.P.C.; Rouy, Z.; Sekowska, A.; Tutino, M.L.; Vallenet, D.; von Heijne, G.; Danchin, A. (2005). Coping with cold: the genome of the versatile marine Antarctica bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125. Genome Research 15(10): 1325-1335. dx.doi.org/10.1101/gr.4126905
In: Genome Research: Cold Spring Harbor. ISSN 1088-9051; e-ISSN 1549-5469
|  |
| Auteurs | | Top |
- Médigue, C.
- Krin, E.
- Pascal, G.
- Barbe, V.
- Bernsel, A.
- Bertin, P.N.
- Cheung, F.
- Cruveiller, S.
|
- D'Amico, S.
- Duilio, A.
- Fang, G.
- Feller, G.
- Ho, C.
- Mangenot, S.
- Marino, G.
- Nilsson, J.
|
- Parrilli, E.
- Rocha, E.P.C.
- Rouy, Z.
- Sekowska, A.
- Tutino, M.L.
- Vallenet, D.
- von Heijne, G.
- Danchin, A.
|
| Abstract |
A considerable fraction of life develops in the sea at temperatures lower than 15°C. Little is known about the adaptive features selected under those conditions. We present the analysis of the genome sequence of the fast growing Antarctica bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125. We find that it copes with the increased solubility of oxygen at low temperature by multiplying dioxygen scavenging while deleting whole pathways producing reactive oxygen species. Dioxygen-consuming lipid desaturases achieve both protection against oxygen and synthesis of lipids making the membrane fluid. A remarkable strategy for avoidance of reactive oxygen species generation is developed by P. haloplanktis, with elimination of the ubiquitous molybdopterin-dependent metabolism. The P. haloplanktis proteome reveals a concerted amino acid usage bias specific to psychrophiles, consistently appearing apt to accommodate asparagine, a residue prone to make proteins age. Adding to its originality, P. haloplanktis further differs from its marine counterparts with recruitment of a plasmid origin of replication for its second chromosome. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
