Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

Characterization of Pseudoalteromonas citrea and P. nigrifaciens isolated from different ecological habitats based on REP-PCR genomic fingerprints Ivanova, E.P.; Matte, G.R.; Matte, M.H.; Coenye, T.; Huq, A.; Colwell, R.R. (2002). Characterization of Pseudoalteromonas citrea and P. nigrifaciens isolated from different ecological habitats based on REP-PCR genomic fingerprints. Syst. Appl. Microbiol. 25(2): 275-283. https://dx.doi.org/10.1078/0723-2020-00103 In: Systematic and Applied Microbiology. Elsevier: Jena. ISSN 0723-2020; e-ISSN 1618-0984

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Non-open access 379003 [ aanvragen ]

---

Trefwoorden

Pseudoalteromonas Gauthier, Gauthier & Christen, 1995 [WoRMS] Marien/Kust

Author keywords

Pseudoalteromonas; biogeography; REP; ERIC; BOX-PCR

---

Auteurs		Top
Ivanova, E.P. Matte, G.R. Matte, M.H.	Coenye, T. Huq, A. Colwell, R.R.

---

Abstract

DNA primers corresponding to conserved repetitive interspersed genomic motifs and PCR were used to show that REP, ERIC and BOX-like DNA sequences are present in marine, oxidative, Gram-negative Pseudoalteromonas strains. REP, ERIC and BOX-PCR were used for rapid molecular characterization of both the type species of the genus and environmental strains isolated from samples collected in different geographical areas. PCR-generated genomic fingerprint patterns were found to be both complex and strain specific. Analysis of the genotypic structure of phenotypically diverse P. citrea revealed a geographic clustering of Far Eastern brown-pigmented, agar-digesting strains of this species. Marine isolates of P. nigrifaciens with 67–70% DNA relatedness generated genomic patterns different from those of the type strain and formed a separate cluster. It is concluded that REP, ERIC and BOX-PCR are effective in generating strain specific patterns that can be used to elucidate geographic distribution, with these genomic patterns providing a valuable biogeographic criterion.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs