Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
SAR202 Genomes from the Dark Ocean Predict Pathways for the Oxidation ofRecalcitrant Dissolved Organic Matter
Landry, Z.; Swan, B.K.; Herndl, G.J.; Stepanauskas, R.; Giovannonia, S.J. (2017). SAR202 Genomes from the Dark Ocean Predict Pathways for the Oxidation ofRecalcitrant Dissolved Organic Matter. Mbio 8(2): e00413-17. https://dx.doi.org/10.1128/mBio.00413-17
In: mBio. American Society for Microbiology: Washington. ISSN 2150-7511; e-ISSN 2150-7511
|   |
| Author keywords |
bathypelagic; Chloroflexi; dissolved organic matter; mesopelagic; monooxygenase; SAR202; single-cell genomics |
| Auteurs | | Top |
- Landry, Z.
- Swan, B.K.
- Herndl, G.J.
|
- Stepanauskas, R.
- Giovannonia, S.J.
|
|
| Abstract |
Deep-ocean regions beyond the reach of sunlight contain an estimated615 Pg of dissolved organic matter (DOM), much of which persists for thousands ofyears. It is thought that bacteria oxidize DOM until it is too dilute or refractory tosupport microbial activity. We analyzed five single-amplified genomes (SAGs) fromthe abundant SAR202 clade of dark-ocean bacterioplankton and found they encodemultiple families of paralogous enzymes involved in carbon catabolism, includingseveral families of oxidative enzymes that we hypothesize participate inthe degradation of cyclic alkanes. The five partial genomes encoded 152 flavinmononucleotide/F420-dependent monooxygenases (FMNOs), many of which arepredicted to be type II Baeyer-Villiger monooxygenases (BVMOs) that catalyze oxygeninsertion into semilabile alicyclic alkanes. The large number of oxidative enzymes,as well as other families of enzymes that appear to play complementary rolesin catabolic pathways, suggests that SAR202 might catalyze final steps in the biologicaloxidation of relatively recalcitrant organic compounds to refractory compoundsthat persist. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
