Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Single-virus genomics reveals hidden cosmopolitan and abundant viruses
Martinez-Hernandez, F.; Fornas, O.; Lluesma Gomez, M.; Bolduc, B.; de la Cruz Peña, M.J.; Martinez-Martinez, J.; Antón, J.; Gasol, J.M.; Rosselli, R.; Rodriguez-Valera, F; Sullivan, M.B.; Acinas, S.G.; Martinez-Garcia, M. (2017). Single-virus genomics reveals hidden cosmopolitan and abundant viruses. Nature Comm. 8(15892): 13 pp. https://dx.doi.org/10.1038/ncomms15892
In: Nature Communications. Nature Publishing Group: London. ISSN 2041-1723; e-ISSN 2041-1723
|   |
| Auteurs | | Top |
- Martinez-Hernandez, F.
- Fornas, O.
- Lluesma Gomez, M.
- Bolduc, B.
- de la Cruz Peña, M.J.
|
- Martinez-Martinez, J.
- Antón, J.
- Gasol, J.M.
- Rosselli, R.
|
- Rodriguez-Valera, F
- Sullivan, M.B.
- Acinas, S.G.
- Martinez-Garcia, M.
|
| Abstract |
Microbes drive ecosystems under constraints imposed by viruses. However, a lack of virus genome information hinders our ability to answer fundamental, biological questions concerning microbial communities. Here we apply single-virus genomics (SVGs) to assess whether portions of marine viral communities are missed by current techniques. The majority of the here-identified 44 viral single-amplified genomes (vSAGs) are more abundant in global ocean virome data sets than published metagenome-assembled viral genomes or isolates. This indicates that vSAGs likely best represent the dsDNA viral populations dominating the oceans. Species-specific recruitment patterns and virome simulation data suggest that vSAGs are highly microdiverse and that microdiversity hinders the metagenomic assembly, which could explain why their genomes have not been identified before. Altogether, SVGs enable the discovery of some of the likely most abundant and ecologically relevant marine viral species, such as vSAG 37-F6, which were overlooked by other methodologies. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
