Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
PhyloExplorer: a web server to validate, explore and query phylogenetic trees
Ranwez, V.; Clairon, N.; Delsuc, F.; Pourali, S.; Auberval, N.; Diser, S.; Berry, V. (2009). PhyloExplorer: a web server to validate, explore and query phylogenetic trees. BMC Evol. Biol. 9(1): 108. https://dx.doi.org/10.1186/1471-2148-9-108
In: BMC Evolutionary Biology. BioMed Central: London. ISSN 1471-2148; e-ISSN 1471-2148
|   |
| Auteurs | | Top |
- Ranwez, V.
- Clairon, N.
- Delsuc, F.
- Pourali, S.
|
- Auberval, N.
- Diser, S.
- Berry, V.
|
|
| Abstract |
Many important problems in evolutionary biology require molecular phylogenies to be reconstructed. Phylogenetic trees must then be manipulated for subsequent inclusion in publications or analyses such as supertree inference and tree comparisons. However, no tool is currently available to facilitate the management of tree collections providing, for instance: standardisation of taxon names among trees with respect to a reference taxonomy; selection of relevant subsets of trees or sub-trees according to a taxonomic query; or simply computation of descriptive statistics on the collection. Moreover, although several databases of phylogenetic trees exist, there is currently no easy way to find trees that are both relevant and complementary to a given collection of trees. We propose a tool to facilitate assessment and management of phylogenetic tree collections. Given an input collection of rooted trees, PhyloExplorer provides facilities for obtaining statistics describing the collection, correcting invalid taxon names, extracting taxonomically relevant parts of the collection using a dedicated query language, and identifying related trees in the TreeBASE database. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
