Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition Alberti, A.; Poulain, J.; Engelen, S.; Labadie, K.; Romac, S.; Ferrera, I.; Albini, G.; Aury, J.-M.; Belser, C.; Bertrand, A.; Cruaud, C.; Da Silva, C.; Dossat, C.; Gavory, F.; Gas, S.; Guy, J.; Haquelle, M.; Jacoby, E.; Jaillon, O.; Lemainque, A.; Pelletier, E.; Samson, G.; Wessner, M.; Acinas, S.G.; Royo-Llonch, M.; Cornejo-Castillo, F.M.; Logares, R.; Fernandez-Gomez, B.; Bowler, C.; Cochrane, G.; Amid, C.; ten Hoopen, P.; de Vargas, C.; Grimsley, N.; Desgranges, E.; Kandels-Lewis, S.; Ogata, H.; Poulton, N.; Sieracki, M.E.; Stepanauskas, R.; Sullivan, M.B.; Brum, J.R.; Duhaime, M.B.; Poulos, B.T.; Hurwitz, B.L.; Pesant, S.; Karsenti, E.; Wincker, P.; Bork, P.; Boss, E.; Follows, M.; Gorsky, G.; Hingamp, P.; Iudicone, D.; Karp-Boss, L.; Not, F.; Raes, J.; Sardet, C.; Speich, S.; Stemmann, L.; Sunagawa, S.; Bazire, P.; Beluche, O.; Besnard-Gonnet, M.; Bordelais, I.; Boutard, M.; Dubois, M.; Dumont, C.; Ettedgui, E.; Fernández, P.; Garcia, E.; Aiach, N.G.; Guerin, T.; Hamon, C.; Brun, E.; Lebled, S.; Lenoble, P.; Louesse, C.; Mahieu, E.; Mairey, B.; Martins, N.; Megret, C.; Milani, C.; Muanga, J.; Orvain, C.; Payen, E.; Perroud, P.; Petit, E.; Robert, D.; Ronsin, M.; Vacherie, B. (2017). Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition. Scientific Data 4: 20. https://dx.doi.org/10.1038/sdata.2017.93 In: Scientific Data. Nature Publishing Group: London. ISSN 2052-4463; e-ISSN 2052-4463

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Open access 319503 [ download pdf ]

---

Trefwoord

Marien/Kust

---

Auteurs		Top
Alberti, A. Poulain, J. Engelen, S. Labadie, K. Romac, S. Ferrera, I. Albini, G. Aury, J.-M. Belser, C. Bertrand, A. Cruaud, C. Da Silva, C. Dossat, C. Gavory, F. Gas, S. Guy, J. Haquelle, M. Jacoby, E. Jaillon, O. Lemainque, A. Pelletier, E. Samson, G. Wessner, M. Acinas, S.G. Royo-Llonch, M. Cornejo-Castillo, F.M. Logares, R. Fernandez-Gomez, B. Bowler, C. Cochrane, G. Amid, C.	ten Hoopen, P. de Vargas, C. Grimsley, N. Desgranges, E. Kandels-Lewis, S. Ogata, H. Poulton, N. Sieracki, M.E. Stepanauskas, R. Sullivan, M.B. Brum, J.R. Duhaime, M.B. Poulos, B.T. Hurwitz, B.L. Pesant, S. Karsenti, E. Wincker, P. Bork, P. Boss, E. Follows, M. Gorsky, G. Hingamp, P. Iudicone, D. Karp-Boss, L. Not, F. Raes, J. Sardet, C. Speich, S. Stemmann, L. Sunagawa, S.	Bazire, P. Beluche, O. Besnard-Gonnet, M. Bordelais, I. Boutard, M. Dubois, M. Dumont, C. Ettedgui, E. Fernández, P. Garcia, E. Aiach, N.G. Guerin, T. Hamon, C. Brun, E. Lebled, S. Lenoble, P. Louesse, C. Mahieu, E. Mairey, B. Martins, N. Megret, C. Milani, C. Muanga, J. Orvain, C. Payen, E. Perroud, P. Petit, E. Robert, D. Ronsin, M. Vacherie, B.

---

Abstract

A unique collection of oceanic samples was gathered by the Tara Oceans expeditions (2009-2013), targeting plankton organisms ranging from viruses to metazoans, and providing rich environmental context measurements. Thanks to recent advances in the field of genomics, extensive sequencing has been performed for a deep genomic analysis of this huge collection of samples. A strategy based on different approaches, such as metabarcoding, metagenomics, single-cell genomics and metatranscriptomics, has been chosen for analysis of size-fractionated plankton communities. Here, we provide detailed procedures applied for genomic data generation, from nucleic acids extraction to sequence production, and we describe registries of genomics datasets available at the European Nucleotide Archive (ENA, www. ebi. ac. uk/ena). The association of these metadata to the experimental procedures applied for their generation will help the scientific community to access these data and facilitate their analysis. This paper complements other efforts to provide a full description of experiments and open science resources generated from the Tara Oceans project, further extending their value for the study of the world's planktonic ecosystems.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs