Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

GC content of early metazoan genes and its impact on gene expression levels in mammalian cell lines Gul, I.S.; Staal, J.; Hulpiau, P.; De Keuckelaere, E.; Kamm, K.; Deroo, T.; Sanders, E.; Staes, K.; Driege, Y.; Saeys, Y.; Beyaert, R.; Technau, U.; Schierwater, B.; van Roy, F. (2018). GC content of early metazoan genes and its impact on gene expression levels in mammalian cell lines. Genome Biology and Evolution 10(3): 909-917. https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evy040 In: Genome Biology and Evolution. Oxford University Press: Oxford. ISSN 1759-6653; e-ISSN 1759-6653

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Open access 326498 [ download pdf ]

---

Trefwoorden

Placozoa [WoRMS]; Trichoplax adhaerens Schulze, 1883 [WoRMS]

Author keywords

Trichoplax adhaerens; Placozoa; genome evolution; GC content; ectopicexpression

---

Auteurs		Top
Gul, I.S. Staal, J. Hulpiau, P. De Keuckelaere, E. Kamm, K.	Deroo, T. Sanders, E. Staes, K. Driege, Y. Saeys, Y.	Beyaert, R. Technau, U. Schierwater, B. van Roy, F.

---

Abstract

With the genomes available for many animal clades, including the early-branching metazoans, one can readily study the functional conservation of genes across a diversity of animal lineages. Ectopic expression of an animal protein in, for instance, a mammalian cell line is a generally used strategy in structure–function analysis. However, this might turn out to be problematic in case of distantly related species. Here we analyzed the GC content of the coding sequences of basal animals and show its impact on gene expression levels in human cell lines, and, importantly, how this expression efficiency can be improved. Optimization of the GC3 content in the coding sequences of cadherin, alpha-catenin, and paracaspase of Trichoplax adhaerens dramatically increased the expression of these basal animal genes in human cell lines.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs