Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

Barcoding Tetrahymena: Discriminating species and identifying unknowns using the cytochrome c oxidase Subunit I (cox-1) barcode Kher, C.P.; Doerder, F.P.; Cooper, J.; Ikonomi, P.; Achilles-Day, U.; Küpper, F.C.; Lynn, D.H. (2011). Barcoding Tetrahymena: Discriminating species and identifying unknowns using the cytochrome c oxidase Subunit I (cox-1) barcode. Protist 162(1): 2-13. https://dx.doi.org/10.1016/j.protis.2010.03.004 In: Protist. Elsevier: Jena. ISSN 1434-4610; e-ISSN 1618-0941

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Non-open access 351468 [ aanvragen ]

---

Trefwoord

Tetrahymena [WoRMS]

Author keywords

barcode, ciliate, cytochrome c oxidase subunit I (cox-1), DNA barcoding, species identification, Tetrahymena

---

Auteurs		Top
Kher, C.P. Doerder, F.P. Cooper, J. Ikonomi, P.	Achilles-Day, U. Küpper, F.C. Lynn, D.H.

---

Abstract

DNA barcoding using the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (cox-1) gene has recently gained popularity as a tool for species identification of a variety of taxa. The primary objective of our research was to explore the efficacy of using cox-1 barcoding for species identification within the genus Tetrahymena. We first increased intraspecific sampling for Tetrahymena canadensis, Tetrahymena hegewischi, Tetrahymena pyriformis, Tetrahymena rostrata, Tetrahymena thermophila, and Tetrahymena tropicalis. Increased sampling efforts show that intraspecific sequence divergence is typically less than 1%, though it may be more in some species. The barcoding also showed that some strains might be misidentified or mislabeled. We also used cox-1 barcodes to provide species identifications for 51 unidentified environmental isolates, with a success rate of 98%. Thus, cox-1 barcoding is an invaluable tool for protistologists, especially when used in conjunction with morphological studies.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs