Catalogus

Zoeken

Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.

Boekenmand

Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).

RSS

Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.

log in

Publicaties | Kaarten

nieuwe zoekopdracht

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

First sequencing of ancient coral skeletal proteins Drake, J.L.; Whitelegge, J.P.; Jacobs, D.K. (2020). First sequencing of ancient coral skeletal proteins. NPG Scientific Reports 10(1): 19407. https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-75846-4 In: Scientific Reports (Nature Publishing Group). Nature Publishing Group: London. ISSN 2045-2322; e-ISSN 2045-2322

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Open access 355563 [ download pdf ]

---

Auteurs		Top
Drake, J.L. Whitelegge, J.P. Jacobs, D.K.

---

Abstract

Here we report the first recovery, sequencing, and identification of fossil biomineral proteins from a Pleistocene fossil invertebrate, the stony coral Orbicella annularis. This fossil retains total hydrolysable amino acids of a roughly similar composition to extracts from modern O. annularis skeletons, with the amino acid data rich in Asx (Asp + Asn) and Glx (Glu + Gln) typical of invertebrate skeletal proteins. It also retains several proteins, including a highly acidic protein, also known from modern coral skeletal proteomes that we sequenced by LC–MS/MS over multiple trials in the best-preserved fossil coral specimen. A combination of degradation or amino acid racemization inhibition of trypsin digestion appears to limit greater recovery. Nevertheless, our workflow determines optimal samples for effective sequencing of fossil coral proteins, allowing comparison of modern and fossil invertebrate protein sequences, and will likely lead to further improvements of the methods. Sequencing of endogenous organic molecules in fossil invertebrate biominerals provides an ancient record of composition, potentially clarifying evolutionary changes and biotic responses to paleoenvironments.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs