Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Potential and expression of carbohydrate utilization by marine fungi in the global ocean
In: Microbiome. BIOMED CENTRAL LTD: London. e-ISSN 2049-2618
|   |
| Trefwoord |
|
| Author keywords |
Pelagic fungi; CAZYmes; Metagenomic; Metatranscriptomic; Global ocean; Carbon cycle |
| Auteurs | | Top |
- Baltar, F.
- Zhao, Z.
- Herndl, G.J.
|
|
|
| Abstract |
BackgroundMost of the research on the cycling of carbon in the open-ocean has focused on heterotrophic prokaryotes and eukaryotic phytoplankton, but the role of pelagic fungi remains largely enigmatic.MethodsHere, we performed a global-ocean multi-omics analysis of all pelagic fungal carbohydrate-active enzymes (CAZymes), key enzymes in the carbon cycling. We studied the occurrence, expression, diversity, functional classification, and taxonomic affiliation of the genes encoding all pelagic fungal CAZymes from the epi- and mesopelagic realm.ResultsPelagic fungi are active in carbohydrate degradation as indicated by a high ratio of CAZymes transcripts per gene. Dothideomycetes in epipelagic and the Leotiomycetes in mesopelagic waters (both from the phylum Ascomycota) are the main pelagic fungi responsible for carbohydrate degradation in the ocean. The abundance, expression, and diversity of fungal CAZymes were higher in the mesopelagic than in the epipelagic waters, in contrast to the distribution pattern of prokaryotic CAZymes.ConclusionsOur results reveal a widespread utilization of different types of CAZymes by pelagic fungi, uncovering an active and hitherto largely unexplored participation of fungi in the pelagic C cycling, where pelagic prokaryotes and fungi occupy different ecological niches, and fungi becoming relatively more important with depth. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
