Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
The ontology of the amphioxus anatomy and life cycle (AMPHX)
Bertrand, S.; Carvalho, J.E.; Dauga, D.; Matentzoglu, N.; Daric, V.; Yu, J.-K.; Schubert, M.; Escriva, H. (2021). The ontology of the amphioxus anatomy and life cycle (AMPHX). Front. Cell Dev. Biol. 9: 668025. https://dx.doi.org/10.3389/fcell.2021.668025
In: Frontiers in Cell and Developmental Biology. Frontiers Media SA: Lausanne. e-ISSN 2296-634X
|   |
| Trefwoorden |
ASSEMBLEPlus Joint Research Activity 3
Biology > Anatomy
Cycles > Life cycle
Scientific Publication
Branchiostoma Costa, 1834 [WoRMS]; Cephalochordata [WoRMS]
|
| Author keywords |
amphioxus (lancelet), ontology (ontologie), cephalochordates, evodevo model organisms, |
| Auteurs | | Top |
- Bertrand, S.
- Carvalho, J.E.
- Dauga, D.
- Matentzoglu, N.
|
- Daric, V.
- Yu, J.-K.
- Schubert, M.
- Escriva, H.
|
|
| Abstract |
An ontology is a computable representation of the different parts of an organism and its different developmental stages as well as the relationships between them. The ontology of model organisms is therefore a fundamental tool for a multitude of bioinformatics and comparative analyses. The cephalochordate amphioxus is a marine animal representing the earliest diverging evolutionary lineage of chordates. Furthermore, its morphology, its anatomy and its genome can be considered as prototypes of the chordate phylum. For these reasons, amphioxus is a very important animal model for evolutionary developmental biology studies aimed at understanding the origin and diversification of vertebrates. Here, we have constructed an amphioxus ontology (AMPHX) which combines anatomical and developmental terms and includes the relationships between these terms. AMPHX will be used to annotate amphioxus gene expression patterns as well as phenotypes. We encourage the scientific community to adopt this amphioxus ontology and send recommendations for future updates and improvements. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
