Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Biogeography of the fish pathogen Aeromonas salmonicida inferred by vapA genotyping
Gulla, S.; Bayliss, S.; Björnsdóttir, B.; Dalsgaard, I.; Haenen, O.; Jansson, E.; McCarthy, U.; Scholz, F.; Vercauteren, M.; Verner-Jeffreys, D.; Welch, T.; Wiklund, T.; Colquhoun, D.J. (2019). Biogeography of the fish pathogen Aeromonas salmonicida inferred by vapA genotyping. FEMS Microbiol. Lett. 366(7): fnz074. https://dx.doi.org/10.1093/femsle/fnz074
In: FEMS. Microbiology letters. Elsevier/North-Holland: Amsterdam. ISSN 0378-1097; e-ISSN 1574-6968
|   |
| Trefwoord |
Aeromonas salmonicida (Lehmann & Neumann, 1896) Griffin, Snieszko & Friddle, 1953 [WoRMS]
|
| Author keywords |
aquaculture, bacterial fish pathogen, Aeromonas salmonicida, vapA/A-layer, genotyping, host specificity |
| Auteurs | | Top |
- Gulla, S.
- Bayliss, S.
- Björnsdóttir, B.
- Dalsgaard, I.
- Haenen, O.
|
- Jansson, E.
- McCarthy, U.
- Scholz, F.
- Vercauteren, M.
|
- Verner-Jeffreys, D.
- Welch, T.
- Wiklund, T.
- Colquhoun, D.J.
|
| Abstract |
A recently described typing system based on sequence variation in the virulence array protein (vapA) gene, encoding the A-layer surface protein array, allows unambiguous subtyping of Aeromonas salmonicida. In the present study, we compile A-layer typing results from a total of 675 A. salmonicida isolates, recovered over a 59-year period from 50 different fish species in 26 countries. Nine novel A-layer types (15–23) are identified, several of which display a strong predilection towards certain fish hosts, including e.g. Cyprinidae and Pleuronectidae species. Moreover, we find indications that anthropogenic transport of live fish may have aided the near global dissemination of two cyprinid-associated A-layer types. Comparison of whole genome phylogeny and A-layer typing for a subset of strains further resulted in compatible tree topologies, indicating the utility of vapA as a phylogenetic as well as an epizootiological marker in A. salmonicida. A Microreact project (microreact.org/project/r1pcOAx9m) has been created, allowing public access to the vapA analyses and relevant metadata. In sum, the results generated provide valuable insights into the global population structure of A. salmonicida, particularly in relation to its piscine host spectrum and the geographic distribution of these hosts. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
