Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Hyperactive nanobacteria with host-dependent traits pervade Omnitrophota
Seymour, C.O.; Palmer, M.; Becraft, E.D.; Stepanauskas, R.; Friel, A.D.; Schulz, F.; Woyke, T.; Eloe-Fadrosh, E.; Lai, D.; Jiao, J.-Y.; Hua, Z.-S.; Liu, L.; Lian, Z.-H.; Li, W.-J.; Chuvochina, M.; Finley, B.K.; Koch, B.J.; Schwartz, E.; Dijkstra, P.; Moser, D.P.; Hungate, B.A.; Hedlund, B.P. (2023). Hyperactive nanobacteria with host-dependent traits pervade Omnitrophota. Nature Microbiology 8(4): 727-744. https://dx.doi.org/10.1038/s41564-022-01319-1
In: Nature Microbiology. Springer Nature: London. ISSN 2058-5276
|   |
| Auteurs | | Top |
- Seymour, C.O.
- Palmer, M.
- Becraft, E.D.
- Stepanauskas, R.
- Friel, A.D.
- Schulz, F.
- Woyke, T.
- Eloe-Fadrosh, E.
|
- Lai, D.
- Jiao, J.-Y.
- Hua, Z.-S.
- Liu, L.
- Lian, Z.-H.
- Li, W.-J.
- Chuvochina, M.
|
- Finley, B.K.
- Koch, B.J.
- Schwartz, E.
- Dijkstra, P.
- Moser, D.P.
- Hungate, B.A.
- Hedlund, B.P.
|
| Abstract |
Candidate bacterial phylum Omnitrophota has not been isolated and is poorly understood. We analysed 72 newly sequenced and 349 existing Omnitrophota genomes representing 6 classes and 276 species, along with Earth Microbiome Project data to evaluate habitat, metabolic traits and lifestyles. We applied fluorescence-activated cell sorting and differential size filtration, and showed that most Omnitrophota are ultra-small (~0.2 μm) cells that are found in water, sediments and soils. Omnitrophota genomes in 6 classes are reduced, but maintain major biosynthetic and energy conservation pathways, including acetogenesis (with or without the Wood-Ljungdahl pathway) and diverse respirations. At least 64% of Omnitrophota genomes encode gene clusters typical of bacterial symbionts, suggesting host-associated lifestyles. We repurposed quantitative stable-isotope probing data from soils dominated by andesite, basalt or granite weathering and identified 3 families with high isotope uptake consistent with obligate bacterial predators. We propose that most Omnitrophota inhabit various ecosystems as predators or parasites. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
