Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Complete mitogenome and phylogenetic analysis of a marine ray-finned fish, Alcichthys elongatus (Perciformes: Cottidae)
Patil, M.P.; Kim, J.-O.; Yoo, S.H.; Seo, Y.B.; Lee, Y.-J.; Kim, J.-K.; Kitamura, S.-I.; Kim, G.-D. (2023). Complete mitogenome and phylogenetic analysis of a marine ray-finned fish, Alcichthys elongatus (Perciformes: Cottidae). Fishes 8(10): 513. https://dx.doi.org/10.3390/fishes8100513
In: Fishes. MDPI: Basel. ISSN 2410-3888; e-ISSN 2410-3888
|   |
| Trefwoorden |
Alcichthys elongatus (Steindachner, 1881) [WoRMS]; Cottidae Bonaparte, 1831 [WoRMS]; Perciformes [WoRMS]
Marien/Kust |
| Author keywords |
Alcichthys elongatus; Perciformes; Cottidae; mitochondrial genome; phylogenetic analysis; ray-finned fish; marine sculpin |
| Auteurs | | Top |
- Patil, M.P.
- Kim, J.-O.
- Yoo, S.H.
- Seo, Y.B.
|
- Lee, Y.-J.
- Kim, J.-K.
- Kitamura, S.-I.
- Kim, G.-D.
|
|
| Abstract |
Alcichthys elongatus is the only species in the genus, and this work is the first to provide a comprehensive mitogenome analysis of this species. The A. elongatus mitogenome was 16,712 bp long, with biased A + T content (52.33%), and featured thirteen protein-coding genes (PCGs), twenty-two tRNAs, two rRNAs, and the control region (D-loop). The H strand encoded twenty-eight genes (twelve PCGs, fourteen tRNA, and two rRNA) and the control region, whereas the L strand encoded the remaining nine genes (ND6 and eight tRNA). Except for COXI, which started with GTG, all PCG sequences started with ATG and ended with TAA (ND4L, ND5, COXI, ATP8) or TAG (ND1, ND6) termination codons, with some (ND2, ND3, ND4, COXII, COXIII, ATP6, Cytb) having an incomplete termination codon. Except for tRNA-serine-1 (trnS), the majority of the tRNAs exhibited characteristic cloverleaf secondary structures. Based on 13 PCGs, phylogenetic analysis placed A. elongatus in the same clade as Icelus spatula. This genomic data will be useful for species identification, phylogenetic analysis, and population genetics. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
