Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Decoding cnidarian cell type gene regulation
Elek, A.; Iglesias, M.; Mahieu, L.; Zolotarov, G.; Grau-Bové, X.; Aerts, S.; Sebé-Pedrós, A. (2026). Decoding cnidarian cell type gene regulation. Nature Ecology & Evolution 10(1): 140-153. https://dx.doi.org/10.1038/s41559-025-02906-1
In: Nature Ecology & Evolution. Springer Nature. ISSN 2397-334X
|  |
| Trefwoord |
Nematostella vectensis Stephenson, 1935 [WoRMS]
|
| Auteurs | | Top |
- Elek, A.
- Iglesias, M.
- Mahieu, L.
- Zolotarov, G.
|
- Grau-Bové, X.
- Aerts, S.
- Sebé-Pedrós, A.
|
|
| Abstract |
Animal cell types are defined by differential access to genomic information—a process orchestrated by the combinatorial activity of transcription factors that bind to cis-regulatory elements (CREs) to control gene expression. Changes in these gene regulatory networks (GRNs) underlie the origin and diversification of cell types, yet the regulatory logic and specific GRNs that define cell identities remain poorly resolved across the animal tree of life. Cnidarians, as early-branching metazoans, provide a critical window into the early evolution of cell type-specific genome regulation. Here we profiled chromatin accessibility in 60,000 cells from whole adults and gastrula-stage embryos of the sea anemone Nematostella vectensis. We identified 112,728 putative CREs and quantified their activity across cell types, revealing pervasive combinatorial enhancer usage and distinct promoter architectures. To decode the underlying regulatory grammar, we trained sequence-based models predicting CRE accessibility and used these models to infer cell type similarities that reflect known ontogenetic relationships. By integrating sequence motifs, transcription factor expression and CRE accessibility, we reconstructed the GRNs that define cnidarian cell types. Our results show the regulatory complexity underlying cell differentiation in a morphologically simple animal and highlight conserved principles in animal gene regulation. This work provides a foundation for comparative regulatory genomics to understand the evolutionary emergence of animal cell type diversity |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.
