Over het archief
Het OWA, het open archief van het Waterbouwkundig Laboratorium heeft tot doel alle vrij toegankelijke onderzoeksresultaten van dit instituut in digitale vorm aan te bieden. Op die manier wil het de zichtbaarheid, verspreiding en gebruik van deze onderzoeksresultaten, alsook de wetenschappelijke communicatie maximaal bevorderen.
Dit archief wordt uitgebouwd en beheerd volgens de principes van de Open Access Movement, en het daaruit ontstane Open Archives Initiative.
Basisinformatie over ‘Open Access to scholarly information'.
Metagenomics meets time series analysis: unraveling microbial community dynamics
Faust, K.; Lahti, L.; Gonze, D.; de Vos, W.M.; Raes, J. (2015). Metagenomics meets time series analysis: unraveling microbial community dynamics. Curr. Opin. Microbiol. 25: 56-66. https://dx.doi.org/10.1016/j.mib.2015.04.004
In: Current Opinion in Microbiology. Elsevier: London. ISSN 1369-5274; e-ISSN 1879-0364, meer
| |
Auteurs | | Top |
- Faust, K., meer
- Lahti, L.
- Gonze, D.
|
- de Vos, W.M.
- Raes, J., meer
|
|
Abstract |
The recent increase in the number of microbial time series studies offers new insights into the stability and dynamics of microbial communities, from the world's oceans to human microbiota. Dedicated time series analysis tools allow taking full advantage of these data. Such tools can reveal periodic patterns, help to build predictive models or, on the contrary, quantify irregularities that make community behavior unpredictable. Microbial communities can change abruptly in response to small perturbations, linked to changing conditions or the presence of multiple stable states. With sufficient samples or time points, such alternative states can be detected. In addition, temporal variation of microbial interactions can be captured with time-varying networks. Here, we apply these techniques on multiple longitudinal datasets to illustrate their potential for microbiome research. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.