Open WL Archief (OWA)

Over het archief

Het OWA, het open archief van het Waterbouwkundig Laboratorium heeft tot doel alle vrij toegankelijke onderzoeksresultaten van dit instituut in digitale vorm aan te bieden. Op die manier wil het de zichtbaarheid, verspreiding en gebruik van deze onderzoeksresultaten, alsook de wetenschappelijke communicatie maximaal bevorderen.

Dit archief wordt uitgebouwd en beheerd volgens de principes van de Open Access Movement, en het daaruit ontstane Open Archives Initiative.

Basisinformatie over ‘Open Access to scholarly information'.

[ meld een fout in dit record ]

mandje (0): toevoegen | toon

---

The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants Li, Linzhou; Wang, Sibo; Wang, Hongli; Sahu, Sunil Kumar; Marin, Birger; Li, Haoyuan; Xu, Yan; Liang, Hongping; Li, Zhen; Cheng, Shifeng; Reder, Tanja; Çebi, Zehra; Wittek, Sebastian; Petersen, Morten; Melkonian, Barbara; Du, Hongli; Yang, Huanming; Wang, Jian; Wong, Gane Ka-Shu; Xu, Xun; Liu, Xin; Van de Peer, Yves; Melkonian, Michael; Liu, Huan (2020). The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants. Nature Ecology & Evolution 4(9): 1220-1231. https://dx.doi.org/10.1038/s41559-020-1221-7 In: Nature Ecology & Evolution. Springer Nature. ISSN 2397-334X, meer Is gerelateerd aan: Piganeau, G. (2020). A planktonic picoeukaryote makes big changes to the green lineage. Nature Ecology & Evolution 4(9): 1160-1161. https://dx.doi.org/10.1038/s41559-020-1244-0, meer Is gerelateerd aan: Li, L.; Wang, S.; Wang, H.; Sahu, S.K.; Marin, B.; Li, H.; Xu, Y.; Liang, H.; Li, Z.; Cheng, S.; Reder, T.; Çebi, Z.; Wittek, S.; Petersen, M.; Melkonian, B.; Du, H.; Yang, H.; Wang, J.; Wong, G.K.-S.; Xu, X.; Liu, X.; Van de Peer, Y.; Melkonian, M.; Liu, H. (2020). Author correction: The genome of Prasinoderma coloniale unveils the existence of a third phylum within green plants. Nature Ecology & Evolution 4(9): 1280-1280. https://dx.doi.org/10.1038/s41559-020-1268-5, meer

---

Beschikbaar in	Auteurs
VLIZ: Open access 350870 [ download pdf ]

---

Trefwoorden

Prasinoderma coloniale T.Hasegawa & Chihara, 1996 [WoRMS] Marien/Kust

---

Auteurs		Top
Li, Z., meer Van de Peer, Y., meer

---

Abstract

Genome analysis of the pico-eukaryotic marine green alga Prasinoderma coloniale CCMP 1413 unveils the existence of a novel phylum within green plants (Viridiplantae), the Prasinodermophyta, which diverged before the split of Chlorophyta and Streptophyta. Structural features of the genome and gene family comparisons revealed an intermediate position of the P. coloniale genome (25.3 Mb) between the extremely compact, small genomes of picoplanktonic Mamiellophyceae (Chlorophyta) and the larger, more complex genomes of early-diverging streptophyte algae. Reconstruction of the minimal core genome of Viridiplantae allowed identification of an ancestral toolkit of transcription factors and flagellar proteins. Adaptations of P. coloniale to its deep-water, oligotrophic environment involved expansion of light-harvesting proteins, reduction of early light-induced proteins, evolution of a distinct type of C4 photosynthesis and carbon-concentrating mechanism, synthesis of the metal-complexing metabolite picolinic acid, and vitamin B1, B7 and B12 auxotrophy. The P. coloniale genome provides first insights into the dawn of green plant evolution.

---

Alle informatie in het Integrated Marine Information System (IMIS) valt onder het VLIZ Privacy beleid

Top | Auteurs

IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.