Zoeken
Zoeken kan via de modus 'eenvoudig zoeken' (één veld) of uitgebreid via 'geavanceerd zoeken' (meerdere velden). Zo kan je bv. zoeken op een combinatie van een auteursnaam (auteur), een jaartal (jaar) en een documenttype.
Boekenmand
Nuttige resultaten kan je aanvinken en toevoegen aan een mandje. De inhoud hiervan kan je exporteren of afdrukken (naar bv. PDF).
RSS
Op de hoogte blijven van nieuw toegevoegde publicaties binnen uw interessegebied? Dit kan door een RSS-feed (?) te maken van jouw zoekopdracht.
nieuwe zoekopdracht
Conservation of the chitin utilization pathway in the Vibrionaceae
Hunt, D.E.; Gevers, D.; Vahora, N.M.; Polz, M.F. (2008). Conservation of the chitin utilization pathway in the Vibrionaceae. Appl. Environ. Microbiol. 74(1): 44-51. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.01412-07
In: Applied and Environmental Microbiology. American Society for Microbiology: Washington. ISSN 0099-2240; e-ISSN 1098-5336
| |
Auteurs | | Top |
- Hunt, D.E.
- Gevers, D.
- Vahora, N.M.
- Polz, M.F.
|
|
|
Abstract |
Vibrionaceae are regarded as important marine chitin degraders, and attachment to chitin regulates important biological functions; yet, the degree of chitin pathway conservation in Vibrionaceae is unknown. Here, a core chitin degradation pathway is proposed based on comparison of 19 Vibrio and Photobacterium genomes with a detailed metabolic map assembled for V. cholerae from published biochemical, genomic, and transcriptomic results. Further, to assess whether chitin degradation is a conserved property of Vibrionaceae, a set of 54 strains from 32 taxa were tested for the ability to grow on various forms of chitin. All strains grew on N-acetylglucosamine (GlcNAc), the monomer of chitin. The majority of isolates grew on α (crab shell) and β (squid pen) chitin and contained chitinase A (chiA) genes. chiA sequencing and phylogenetic analysis suggest that this gene is a good indicator of chitin metabolism but appears subject to horizontal gene transfer and duplication. Overall, chitin metabolism appears to be a core function of Vibrionaceae, but individual pathway components exhibit dynamic evolutionary histories. |
IMIS is ontwikkeld en wordt gehost door het VLIZ.